蝙蝠冠狀病毒HKU3
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蝙蝠冠狀病毒HKU3![]() | |
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病毒分類 ![]() | |
(未分級): | 病毒 Virus |
域: | 核糖病毒域 Riboviria |
界: | 正核糖病毒界 Orthornavirae |
門: | 小核糖病毒門 Pisuviricota |
綱: | 小南嵌套病毒綱 Pisoniviricetes |
目: | 套式病毒目 Nidovirales |
科: | 冠狀病毒科 Coronaviridae |
屬: | 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus |
亞屬: | SARS乙型冠狀病毒亞屬 Sarbecovirus |
種: | |
毒株: | 蝙蝠冠狀病毒HKU3 HKU3病毒
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蝙蝠冠狀病毒HKU3(BtCoV HKU3;Bat-SARS-CoV HKU3)屬嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒(SARSr-CoV),為SARS-CoV相關病毒,在中華菊頭蝠樣本中發現,是第一個在蝙蝠中發現的SARS相關病毒[1]。HKU3包含13個病毒株,其中HKU3-1、HKU3-2與HKU3-3於2005年發表,在香港的中華菊頭蝠中發現;HKU3-4至HKU3-13於2010年發表,在香港與廣東的中華菊頭蝠樣本中發現。
發表與研究
![](http://images.weserv.nl/?url=//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/7/79/Naturalis_Biodiversity_Center_-_RMNH.MAM.33160.b_ven_-_Rhinolophus_sinicus_-_skin.jpeg/220px-Naturalis_Biodiversity_Center_-_RMNH.MAM.33160.b_ven_-_Rhinolophus_sinicus_-_skin.jpeg)
2004年至2005年,香港大學的研究人員在香港各地採集動物樣本,發現中華菊頭蝠樣本中含有與SARS-CoV相似的冠狀病毒,經全基因組定序得到HKU3-1、HKU3-2與HKU3-3等三個病毒株[2][3],是首次在蝙蝠樣本中發現SARS相關病毒,此前僅知果子貍、貉與鼬獾帶有SARS病毒[1][註 1]。HKU3-1、3-2與3-3的基因組約長29700nt,其序列與SARS-CoV相似度為88%,大部分差異位於刺突蛋白(S)、ORF3與ORF8,其中尤以ORF8差異最大,與果子貍SARS病毒一樣比人類SARS病毒多了一段長29nt的插入序列(但此29個核酸與果子狸病毒的不完全相同),形成一完整的長開放閱讀框,而人類SARS病毒的ORF8則是被分成8a與8b等2個較小的開放閱讀框[5]。
2010年,又有10個與此三個病毒株相近的新病毒株被發表,即為HKU3-4至HKU3-13,基因組長度介於29677nt至29716nt之間,這些病毒株來自2004年至2008年採集的中華菊頭蝠樣本,其中HKU3-7與HKU3-8來自廣東的個體,其他則來自香港的個體,香港的8個毒株彼此序列非常接近(相似度99.9%),和廣東的毒株相似度則為98.5%,這10個新病毒株與2005年發表的3個病毒株共同組成一個演化支。除HKU3-8外的9個病毒株的ORF8皆與果子狸SARS病毒、HKU3-1、3-2與3-3一樣是一個完整的長開放閱讀框,HKU3-8在此處則有一段長26nt的缺失(在人類SARS病毒29nt缺失的附近),將ORF8分為3個較小的開放閱讀框[6]。
HKU3與許多蝙蝠SARSr-CoV一樣在刺突蛋白的受體結合結構域(receptor binding domain, RBD)有兩段分別長5和12個胺基酸的序列缺失(但不見於WIV1病毒與SHC014病毒)[7]
演化樹
截至2021年1月[update],SARS-CoV與相關病毒株的系統發生樹:
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SARS-CoV-2 79 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
註腳
參考文獻
- ^ 1.0 1.1 1.2 1.3 1.4 Ge, Xing-Yi; Hu, Ben; Shi, Zheng-Li. Bat Coronaviruses. Wang, Lin-Fa (編). Bats and Viruses. Hoboken, NJ: John Wiley & Sons, Inc. 2015-06-26: 127–155. ISBN 978-1-118-81882-4. doi:10.1002/9781118818824.ch5 (英語).
- ^ Bat SARS coronavirus HKU3. NCBI Taxonomy Browser.
- ^ Bat coronavirus HKU3 (BtCoV) (SARS-like coronavirus HKU3). Uniprot. [2021-01-24]. (原始內容存檔於2021-04-13).
- ^ 4.0 4.1 4.2 Li, Wendong; Shi, Zhengli; Yu, Meng; Ren, Wuze; Smith, Craig; Epstein, Jonathan H.; Wang, Hanzhong; Crameri, Gary; Hu, Zhihong; Zhang, Huajun; Zhang, Jianhong. Bats Are Natural Reservoirs of SARS-Like Coronaviruses. Science. 2005-10-28, 310 (5748). ISSN 0036-8075. doi:10.1126/science.1118391 (英語).
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