BM48-31病毒

添加链接
本页使用了标题或全文手工转换
维基百科，自由的百科全书
BM48-31病毒
病毒分類 编辑
（未分级）： 病毒 Virus
域： 核糖病毒域 Riboviria
界： 正核糖病毒界 Orthornavirae
门： 小核糖病毒门 Pisuviricota
纲： 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目： 套式病毒目 Nidovirales
科： 冠状病毒科 Coronaviridae
属： 乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus
亚属： SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus
种：
嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒 SARSr-CoV
毒株：
BM48-31病毒 BM48-31

BM48-31病毒（BtCoV/BM48-31/Rhi bla/Bulgaria/2008；BM48–31/BGR/2008）是嚴重急性呼吸系統綜合症相關冠狀病毒（SARSr-CoV）的一個病毒株，在保加利亞布腊氏菊头蝠（英语：Rhinolophus blasii）的糞便樣本中發現，其基因組已被完整定序，於2010年發表[1]。

發現

2008年，研究人員在保加利亞各地採集蝙蝠糞便樣本，經序列分析後發現多種冠狀病毒病毒株，其中屬於SARSr-CoV的可分為兩支，一支皆感染地中海菊头蝠（英语：Rhinolophus euryale），另一支則包含感染布腊氏菊头蝠（英语：Rhinolophus blasii）、馬鐵菊頭蝠與西班牙菊头蝠（英语：Rhinolophus mehelyi）的病毒株，有一布腊氏菊头蝠的病毒株被完整定序，即為BM48-31病毒[1]。

BM48-31病毒的基因組長29276nt[2]，與其他SARSr-CoV相較之下，此病毒株缺乏ORF8（2019年發表的肯亞BtKY72病毒亦不具有ORF8[3]），另外此病毒株的ORF3b和其他蝙蝠SARSr-CoV的一樣比SARS病毒的短，不過相較於Rf1等蝙蝠病毒ORF3b胺基酸序列和SARS病毒的相似度超過90%，BM48-31病毒ORF3a胺基酸序列和SARS病毒的相似度僅有約45%[1]。

分類

種系發生學研究結果顯示BM48-31病毒與BtKY72病毒組成一個演化支，兩者基因組序列相似度為81%[3]，此演化支是SARSr-CoV演化樹的基群，與其他SARSr-CoV分家早於SARS-CoV和SARS-CoV-2分家的時間[4][5]。

SARSr-CoV
 
 
 

BtKY72病毒

 
 
 
 

BM48-31病毒

 
 
 
 
 
 
 
 

SARS-CoV相關病毒

 
 
 
 
 
 
 
 

SARS-CoV-2相關病毒

 
 
 
 
 
 

參考文獻

  1. ^ 1.0 1.1 1.2 Drexler JF, Gloza-Rausch F, Glende J, Corman VM, Muth D, Goettsche M; et al. Genomic characterization of severe acute respiratory syndrome-related coronavirus in European bats and classification of coronaviruses based on partial RNA-dependent RNA polymerase gene sequences.. J Virol. 2010, 84 (21): 11336–49. PMC 2953168 可免费查阅. PMID 20686038. doi:10.1128/JVI.00650-10. 
  2. ^ Bat coronavirus BM48-31/BGR/2008, complete genome. NCBI. [2021-02-21]. （原始内容存档于2022-03-29）. 
  3. ^ 3.0 3.1 Tao Y, Tong S. Complete Genome Sequence of a Severe Acute Respiratory Syndrome-Related Coronavirus from Kenyan Bats.. Microbiol Resour Announc. 2019, 8 (28). PMC 6624766 可免费查阅. PMID 31296683. doi:10.1128/MRA.00548-19. 
  4. ^ Lu R, Zhao X, Li J, Niu P, Yang B, Wu H; et al. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding.. Lancet. 2020, 395 (10224): 565–574. PMC 7159086 可免费查阅. PMID 32007145. doi:10.1016/S0140-6736(20)30251-8. 
  5. ^ Coronaviridae Study Group of the International Committee on Taxonomy of Viruses. The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2.. Nat Microbiol. 2020, 5 (4): 536–544. PMC 7095448 可免费查阅. PMID 32123347. doi:10.1038/s41564-020-0695-z. 
 
甲型冠狀病毒屬
（α-CoV）
甲型冠狀病毒1型
甲型冠狀病毒2型
雪貂冠狀病毒（FRECV · FRSCV） · 水鼬冠狀病毒（MCoV）
229E病毒
人類冠狀病毒229E（HCoV-229E） · 羊駝冠狀病毒（ACoV） · 單峰駱駝229E樣冠狀病毒 · 蝙蝠229E樣冠狀病毒
NL63病毒
長翼蝠冠狀病毒HKU8（Bat-CoV HKU8） · 長翼蝠冠狀病毒1型（Bat-CoV 1A/1B） · 褐扁顱蝠冠狀病毒HKU33（Tr-BatCoV HKU33）
其他
鼩鼱冠狀病毒T14（Sa-CoV T14） · 文成鼩鼱病毒（WESV） · 鹿城褐家鼠冠状病毒（LRNV）
乙型冠狀病毒屬
（β-CoV）
Embecovirus（英语：Embecovirus）
（支系A）
乙型冠狀病毒1型（β1CoV）
牛冠狀病毒（BCoV） · 人類冠狀病毒OC43（HCoV-OC43） · 馬冠狀病毒（ECoV） · 豬凝血性腦脊髓炎病毒（PHEV） · 犬呼吸道冠狀病毒（CRCoV）
兔冠狀病毒HKU14（RbCoV HKU14） · 黃鼠冠狀病毒HKU24（ChRCoV HKU24） · 龍泉黑線姬鼠冠狀病毒（LAMV）
鼠冠狀病毒（M-CoV）
鼠肝炎病毒（MHV） · 大鼠冠狀病毒（RCoV）（大鼠涎淚腺炎病毒SDAV · 帕克RCoV）
人類冠狀病毒HKU1（HCoV-HKU1） · 龍泉羅賽鼠冠狀病毒（LRLV）
Merbecovirus（英语：Merbecovirus）
（支系C）
刺蝟冠狀病毒（EriCoV） · 東北刺蝟冠狀病毒HKU31（Ea-HedCoV HKU31） · 扁颅蝠冠状病毒HKU4（Bat-CoV HKU4） · 伏翼蝠冠状病毒HKU5（Bat-CoV HKU5） · 中東呼吸綜合症冠狀病毒（MERS-CoV） · 祖魯棕蝠冠狀病毒（NeoCoV） · 灰伏翼冠狀病毒HKU25（Hp-BatCoV HKU25）
Nobecovirus（英语：Nobecovirus）（支系D）
果蝠冠状病毒GCCDC1（Ro-BatCoV GCCDC1） · 果蝠冠状病毒HKU9（Ro-BatCoV HKU9）
Hibecovirus（英语：Hibecovirus）                            
普氏蹄蝠冠狀病毒ZJ013（BtHp-BetaCoV/ZJ2013）
Sarbecovirus（支系B）                            
SARS-CoV-1 · SARS-CoV-2 · 变种 · 蝙蝠SARSr-CoV（詳见Template:SARSr-CoV）
丙型冠状病毒属
（γ-CoV）
Cegacovirus
鯨豚冠狀病毒（白鯨冠狀病毒SW1 · 瓶鼻海豚冠狀病毒HKU22）
Brangacovirus（英语：Brangacovirus）
Igacovirus（英语：Igacovirus）
禽冠狀病毒（傳染性支氣管炎病毒） · 禽冠狀病毒9203（火雞冠狀病毒）
丁型冠狀病毒屬
（δ-CoV）
鵯冠狀病毒HKU11（BuCoV HKU11） · 鶇冠狀病毒HKU12（ThCoV HKU12） · 文鳥冠狀病毒HKU13（英语：Munia coronavirus HKU13）（MuCoV HKU13） · 猪丁型冠状病毒（PdCV） · 繡眼冠狀病毒HKU16（英语：White-eye coronavirus HKU16）（WeCoV HKU16） · 麻雀冠狀病毒HKU17（SpCoV HKU17） · 鵲鴝冠狀病毒HKU18（MRCoV HKU18） · 夜鷺冠狀病毒HKU19 · 鴨冠狀病毒HKU20（WiCoV HKU20） · 紅冠水雞冠狀病毒HKU21（英语：Common moorhen coronavirus HKU21）（CMCoV HKU21） · 隼冠狀病毒HKU27（FalCoV UAE-HKU27） · 翎頜鴇冠狀病毒HKU28（HouCoV UAE-HKU28） · 鴿冠狀病毒HKU29（PiCoV UAE-HKU29） · 鵪鶉冠狀病毒HKU30（QuaCoV UAE-HKU30）
 
SARSr-CoV
SARS-CoV-1相關病毒
人類病毒
蝙蝠病毒
HKU3 · Rm1 · Rf1 · Rp3 · Rs672 · SHC014 · WIV1 · LYRa11 · YNLF 31C · YNLF 34C · WIV16 · 16BO133
其他
SARS-CoV-2相關病毒
人類病毒
變異株
需要关注的变异株（英语：SARS-CoV-2 variant of concern）（VOC）
Omicron（B.1.1.529）
子谱系：BA.1、BA.1.1、BA.2、BA.2.10.1、BA.2.12、BA.2.12.1、BA.2.75、BA.2.75.2、BA.2.86、BA.3、BA.4、BA.5、BA.5.2.1、BF.7、BQ.1、BQ.1.1、CH.1.1、EG.5、EG.5.1、JN.1、XBB、XBB.1、XBB.1.5、XBB.1.9.2、XBB.1.16、XBF、XE（西班牙语：Variante XE del SARS-CoV-2）
原需要关注的变异株
Alpha（B.1.1.7）（带E484K版本）（書面挪威語：Lineage B.1.1.7 with E484K） · Beta（B.1.351） · Gamma（P.1） · Delta（B.1.617.2）
原需要留意的变异株（阿拉伯语：متحور مثير للاهتمام）（VOI）
及监视下的变异株（阿拉伯语：متحور قيد المراقبة）（VUM）
Zeta（英语：SARS-CoV-2 Zeta variant）（P.2） · Theta（英语：SARS-CoV-2 Theta variant）（P.3） · Epsilon（英语：SARS-CoV-2 Epsilon variant）（B.1.427、B.1.429（書面挪威語：Lineage B.1.429）、CAL.20C） · Kappa（B.1.617.1） · Iota（英语：SARS-CoV-2 Iota variant）（B.1.526） · Eta（英语：SARS-CoV-2 Eta variant）（B.1.525） · Lambda（C.37） · Mu（B.1.621）
曾監視的變異株（FMV）
AV.1 · AT.1 · R.1（西班牙语：Variante R.1 del SARS-CoV-2） · B.1.466.2 · B.1.1.519 · C.36.3 · B.1.214.2 · B.1.1.523（西班牙语：B.1.1.523） · B.1.619 · B.1.620（書面挪威語：Lineage B.1.620） · B.1.1.318（書面挪威語：Lineage B.1.1.318）/AZ.5 · C.1.2（他加禄语：SARS-CoV-2 Lineage C.1.2） · B.1.630 · B.1.640 · XD
其他变种
B.1.1.207（書面挪威語：Lineage B.1.1.207） · B.1.1.317 · B.1.616（書面挪威語：Den bretonske koronavarianten） · B.1.618（書面挪威語：Lineage B.1.618） · B.1.640.2（德语：B.1.640.2） · Deltacron（書面挪威語：«Deltacron»） · XF · Cluster 5（英语：Cluster 5）（已消亡）
错义突变
del 69-70 · RSYLTPGD246-253N · N440K · G446V · L452R（書面挪威語：Mutasjon L452R） · Y453F · S477G/N · E484Q（書面挪威語：Mutasjon E484Q） · E484K（書面挪威語：Mutasjon E484K） · F490S · N501Y（書面挪威語：Mutasjon N501Y） · N501S · D614G（書面挪威語：Mutasjon D614G） · Q677P/H · P681H（書面挪威語：Mutasjon P681H） · P681R（書面挪威語：Mutasjon P681R） · A701V（書面挪威語：Mutasjon A701B og mutasjon A701V）
蝙蝠病毒
RaTG13 · RmYN02 · RacCS203（英语：RacCS203） · RshSTT182 · RshSTT200 · ZC45 · ZXC21 · Rc-o319
其他
穿山甲冠狀病毒（GD · GX · Pangolin-CoV-2020）
其他
相關病毒
Ghana348相關 · HKU9 · BtKY18樣 · BtHp-BetaCoV/ZJ2013
取自“https://zh.wikipedia.org/w/index.php?title=BM48-31病毒&oldid=70946539”