方尖碑 (生物学)
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方尖碑(英文:obelisk)是一种“类病毒样元素”,首次在2024年1月的一篇预印本中描述,其作者称“方尖碑形成了自己独特的系统发育群”[1][2][3],因为它们的RNA序列,由计算机辅助的元转录组学发现,与任何其他生命形式的遗传密码不同源[1]。
由于它们与其他生物的关系未知,它们是一个地位未定的群。
分布和病理学
![](http://images.weserv.nl/?url=//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/e3/Streptococcus_sanguinis_in_Gram_Staining_of_Culture_Microscopy_at_a_Magnification_of_4000X.jpg/220px-Streptococcus_sanguinis_in_Gram_Staining_of_Culture_Microscopy_at_a_Magnification_of_4000X.jpg)
在人类粪便样本中发现了方尖碑,并且在取自人类口腔的血链球菌中也有。一些人类主体携带方尖碑超过300天。最初的研究显示,在所有大陆居住的个体的粪便样本中,大约有7%的样本中存在方尖碑,唾液样本约有50%[1]。
方尖碑对人类健康的影响,如果有的话,尚待确定[2],以及它们的生命周期和复制依赖于什么因素等问题[1]。
遗传学和生物化学
方尖碑的特征包括具有约1000个碱基对的环形RNA基因组组装件,以及囊括整个基因组的棒状二级结构。与类病毒相反,它们的RNA被翻译成蛋白质,在预印本中暂时称为“oblin”。那里列出的两种蛋白质已被命名为Oblin-1和Oblin-2[1]。
首次结构预测表明,Oblin-1可以结合金属离子,因此可能参与细胞信号传导。Oblin-2具有典型的蛋白质复合物结合位点,因此可能与其宿主细胞的酶结合[2]。
名称
预印本说:“由于有强预测的棒状二级结构,我们将这组RNA称为方尖碑-alpha。”...“长1164 nt,棒状二级结构非常显著...”[1](相对于环形组装结构的二级结构。)
参考资料
- ^ 1.0 1.1 1.2 1.3 1.4 1.5 Ivan N. Zheludev; Robert C. Edgar; Maria Jose Lopez-Galiano; Marcos de la Peña; Artem Babaian; Ami S. Bhatt; Andrew Z. Fire. Viroid-like colonists of human microbiomes. BioRxiv. 2024-01-21. PMC 10827157
. PMID 38293115. doi:10.1101/2024.01.20.576352. Wikidata Q124389714 (英语).
- ^ 2.0 2.1 2.2 Sidik, Saima. 'Wildly weird' RNA bits discovered infesting the microbes in our guts. Nature. 29 January 2024 [31 January 2024]. PMID 38291328. S2CID 267332809. doi:10.1038/d41586-024-00266-7. (原始内容存档于30 January 2024).
- ^ Pennisi, Elizabeth. 'It's insane': New viruslike entities found in human gut microbes. Science. 26 January 2024 [31 January 2024]. doi:10.1126/science.znxt3dk. (原始内容存档于30 January 2024).