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果蝠冠状病毒GCCDC1

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果蝠冠状病毒GCCDC1
病毒分类 编辑
(未分级) 病毒 Virus
域: 核糖病毒域 Riboviria
界: 正核糖病毒界 Orthornavirae
门: 小核糖病毒门 Pisuviricota
纲: 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目: 套式病毒目 Nidovirales
科: 冠状病毒科 Coronaviridae
属: 乙型冠状病毒属 Betacoronavirus
种:
果蝠冠状病毒GCCDC1 Rousettus bat coronavirus GCCDC1

果蝠冠状病毒GCCDC1(Rousettus bat coronavirus GCCDC1、Ro-BatCoV GCCDC1)是乙型冠状病毒属的一种病毒,与果蝠冠状病毒HKU9的关系接近,于2016年在中国云南棕果蝠体内发现。此病毒有一辅助蛋白基因p10不见于其他冠状病毒中,可能是来自正呼肠孤病毒属的病毒[1]

基因组

果蝠冠状病毒GCCDC1的基因组长约30100nt,编码冠状病毒皆有的复制酶(1a/1b)和刺突蛋白(S)、膜蛋白(M)、外膜蛋白(E)与衣壳蛋白(N)等四种结构蛋白,另外还有NS3、p10、NS7a、NS7b与NS7c等五个开放阅读框编码辅助蛋白,其基因顺序为1ab-S-NS3-E-M-N-p10-NS7a-NS7b-NS7c。其中p10蛋白为果蝠冠状病毒GCCDC1的最大特色,此蛋白不见于任何其他冠状病毒,却与感染鸟类、蝙蝠的正呼肠孤病毒属(属呼肠孤病毒科,为双股RNA病毒英语Double-stranded RNA viruses)病毒的p10蛋白序列相似,很可能是与正呼肠孤病毒发生重组的结果[1]

分类

序列分析显示果蝠冠状病毒GCCDC1与果蝠冠状病毒HKU9的关系接近,这两种病毒共同组成乙型冠状病毒属的支系D(lineage D),后来有学者将其称为Nobecovirus亚属,在乙型冠状病毒属中与SarbecovirusSARS-CoVSARS-CoV-2)和Hibecovirus蹄蝠乙型冠状病毒浙江2013)关系较为接近[2]

参考文献

  1. ^ 1.0 1.1 Baker, Susan; Huang, Canping; Liu, William J.; Xu, Wen; Jin, Tao; Zhao, Yingze; Song, Jingdong; Shi, Yi; Ji, Wei; Jia, Hao; Zhou, Yongming; Wen, Honghua; Zhao, Honglan; Liu, Huaxing; Li, Hong; Wang, Qihui; Wu, Ying; Wang, Liang; Liu, Di; Liu, Guang; Yu, Hongjie; Holmes, Edward C.; Lu, Lin; Gao, George F. A Bat-Derived Putative Cross-Family Recombinant Coronavirus with a Reovirus Gene. PLOS Pathogens. 2016, 12 (9): e1005883. ISSN 1553-7374. doi:10.1371/journal.ppat.1005883. 
  2. ^ Lu, Roujian; Zhao, Xiang; Li, Juan; Niu, Peihua; Yang, Bo; Wu, Honglong; Wang, Wenling; Song, Hao; Huang, Baoying; Zhu, Na; Bi, Yuhai; Ma, Xuejun; Zhan, Faxian; Wang, Liang; Hu, Tao; Zhou, Hong; Hu, Zhenhong; Zhou, Weimin; Zhao, Li; Chen, Jing; Meng, Yao; Wang, Ji; Lin, Yang; Yuan, Jianying; Xie, Zhihao; Ma, Jinmin; Liu, William J; Wang, Dayan; Xu, Wenbo; Holmes, Edward C; Gao, George F; Wu, Guizhen; Chen, Weijun; Shi, Weifeng; Tan, Wenjie. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. The Lancet. 2020, 395 (10224): 565–574. ISSN 0140-6736. doi:10.1016/S0140-6736(20)30251-8.