數量性狀基因座（英語：Quantitative trait locus，簡稱為QTLs）是一段含主控或聯繫數量性狀的基因的DNA。可通過如AFLP或更常見的SNP等分子標籤將這些控制數量性狀的基因定位到基因組的特定區域上。這是對主控性狀變異的實際基因進行鑑定與測序的先行步驟。數量性狀指的是那些可區分程度的表型（特徵），這些性狀起因於多基因效應（即由兩個及以上的基因共同控制）及環境的共同作用。
