巡防區(英語:Patrol and Defense Command)是一些國家的海軍之中擔負特定海陸區域獨立作戰、巡邏、警戒、岸防守備等任務的團級建制戰鬥部隊,並為轄區內海軍兵力駐泊提供勤務保障。通常轄小型水面戰鬥艦艇、勤務輔助船、岸防守備部隊、防空部隊和觀察通信部隊等。 一般隸屬於水警區或直屬於艦隊。中國海軍的巡防區通常按其領導機關的駐地命名。
中國人民解放軍海軍最早組建的巡防區是1950年成立的連雲港巡防區. 現存的有南沙巡防區.