遞減聚合酶鏈式反應
(重定向自递减PCR)
遞減PCR,亦稱降落PCR(英語:touchdown PCR)是一種PCR(聚合酶鏈式反應)方法,用來避免非特異性序列的擴增。PCR中引物的黏合溫度(annealing temperature)決定了黏合的特異性,溫度越高特異性越強,但過高則不能實現引物和模板的結合,而過低會產生大量非特異性產物。因此進行PCR時需要尋找合適的黏合溫度。
遞減PCR開始先設定一個比較高的黏合溫度,每個循環黏合溫度下降1℃,到一個較低溫度以後每個循環的黏合溫度保持不變直到結束。在剛下降到特異性結合可以進行的最高溫度時,可以達到最高的特異性。這樣在起初的幾個循環中,特異性擴增序列可以相對非特異性序列多擴增若干倍,從而減輕非特異性擴增對結果的干擾。這種方法可用於省去多次試驗最佳黏合溫度的工作。
此外,遞減PCR還可與簡併引物(degenerate primer)結合使用,用來推出一段已知肽鏈的氨基酸序列所對應的DNA鹼基序列。
參考文獻
- Don R, Cox P, Wainwright B, Baker K, Mattick J. 'Touchdown' PCR to circumvent spurious priming during gene amplification. Nucleic Acids Res. 1991, 19 (14): 4008. PMC 328507 . PMID 1861999. doi:10.1093/nar/19.14.4008.
- Roux K. Using mismatched primer-template pairs in touchdown PCR. Biotechniques. 1994, 16 (5): 812–4. PMID 8068332.
- Hecker K, Roux K. High and low annealing temperatures increase both specificity and yield in touchdown and stepdown PCR. Biotechniques. 1996, 20 (3): 478–85. PMID 8679209.