病毒分类表
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本頁面列出了病毒的分類,包含病毒以及類病毒、普利昂蛋白、卫星病毒等亞病毒因子。
生物分類表 |
由於病毒並不像其他生物能藉由交配產生後代,因此在種別的定義上與一般生物有所不同。
概论
ICTV 分类法
國際病毒分類委員會(英文:International Committee on Taxonomy of Viruses,簡稱 ICTV)是国际微生物学联合会(英文:International Union of microgical Societies)发展、改进和维护通用病毒分类的唯一机构,在1966年建立起了一个病毒分类的通用系统和统一的命名法则。第七届 ICTV 会议首次规范化了病毒物种的概念,即病毒分类的分支层次中的最低分類單元[1]。分類的主要依據是病毒顆粒的特性、抗原特性與生物特性。
到目前为止只有一小部分的病毒得到了研究,从来自人体的病毒样品中发现有20%的序列是未曾发现过的,而来自环境中(如海水、大洋沉积物等)的病毒样品则大部分的序列都是全新的[2]。
病毒分类从域开始,结构如下,分类后缀在括号中:[3]
- 域 Realm(-viria)
物种名称通常以[疾病]病毒的形式出现,尤其是高等动植物。 ICTV 2023版分类表中总共有6个域、10个界、18个门、2个亚门、41个纲、81个目、11个亚目、314个科、200个亚科、3522个属、84个亚属与14690个种。除亚域、亚界和亚纲外,其他级别的分类单元都被使用。共有6个域、1个地位未定纲、22个地位未定科及2个地位未定属被承认[4]。
巴尔的摩分类法
![](http://images.weserv.nl/?url=//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/18/Virus_Baltimore_Classification.svg/300px-Virus_Baltimore_Classification.svg.png)
诺贝尔奖获得者生物学家戴维·巴尔的摩在1970年代提出了巴尔的摩分类系统[5]。巴尔的摩分类法与ICTV分类法一起用于现代病毒的分类[6][7][8]。
巴尔的摩分类法是基于病毒 mRNA 的生成机制。在从病毒基因组到蛋白质的过程中,必须要生成mRNA来完成蛋白质合成和基因组的复制,但每一个病毒家族都采用不同的机制来完成这一过程。病毒基因组可以是单链或双链的 RNA 或 DNA,可以有也可以没有反转录酶。而且,单链RNA病毒可以是正义(+)或反义(-)。这一分类法将病毒分为7类:
- 第一类是双链 DNA 病毒(如腺病毒、疱疹病毒、痘病毒)
- 第二类是单链 DNA 病毒(+)DNA(如小 DNA 病毒)
- 第三类是双链RNA病毒(如呼腸孤病毒)
- 第四类是(+)单链RNA病毒(如微小核糖核酸病毒、披盖病毒)
- 第五类是(-)单链RNA病毒(如正黏液病毒、炮彈病毒)
- 第六类是单链RNA反转录病毒(如反转录病毒)
- 第七类是双链 DNA 反转录病毒(如肝病毒)
举一个病毒分类的例子:水痘病毒,即带状疱疹病毒,属于疱疹病毒目,疱疹病毒科,甲型疱疹病毒亚科,水疱病毒属;同时,带状疱疹病毒是巴尔的摩分类法中的第一类,因为它是双链 DNA 病毒,且不含有反转录酶。
ICTV 2023版病毒分类表
此套分類系统与细胞生物分类系统有许多共同特征,如分類單元结构,但也存在一些差异,比如所有分类名称都使用斜体,这与国际藻类、真菌和植物命名法及国际动物命名法不同。
A型DNA病毒域 Adnaviria
- 齐利希病毒界 Zilligvirae 1门
雙鏈去氧核糖核酸病毒域 Duplodnaviria
- 香港病毒界 Heunggongvirae 2门
- 衣壳病毒门 Peploviricota 1纲
- 尾噬菌体门 Uroviricota 1纲
- 有尾噬菌体纲 Caudoviricetes 1目
- 有尾噬菌体目 Caudovirales
- crAss噬菌体目 Crassvirales
- 海港噬菌体目 Juravirales
- 千面噬菌体目 Kirjokansivirales
- 海洋组噬菌体目 Magrovirales
- 敖广噬菌体科 Aoguangviridae
- 甲烷杆噬菌体目 Methanobavirales
- 纳孔噬菌体目 Nakonvirales
- 苏雷玛噬菌体目 Thumleimavirales
- 埃凯曼病毒科 Ackermannviridae
- 集聚噬菌体科 Aggregaviridae
- 艾莉丝·埃文斯噬菌体科 Aliceevansviridae
- 阿伦伯格噬菌体科 Arenbergviridae
- 规范噬菌体科 Assiduviridae
- 自复制短尾噬菌体科 Autographiviridae
- 卡斯金斯噬菌体科 Casjensviridae
- 蔡斯噬菌体科 Chaseviridae
- 科 Chimalliviridae
- 科 Clermontviridae
- 德默莱兹噬菌体科 Demerecviridae
- 德雷克斯勒噬菌体科 Drexlerviridae
- 杜恩噬菌体科 Duneviridae
- 热噬菌体科 Fervensviridae
- 凡赛提噬菌体科 Forsetiviridae
- 弗雷德·法斯蒂尔噬菌体科 Fredfastierviridae
- 格里蒙噬菌体科 Grimontviridae
- 格兰噬菌体科 Guelinviridae
- 赫尔戈兰噬菌体科 Helgolandviridae
- 赫莱尔噬菌体科 Herelleviridae
- 克列兹考斯卡噬菌体科 Kleczkowskaviridae
- 科 Konodaiviridae
- 蓝绿噬藻体科 Kyanoviridae
- 科 Lutetiaviridae
- 玛萨噬菌体科 Madisaviridae
- 马德里噬菌体科 Madridviridae
- 梅西扬日诺夫噬菌体科 Mesyanzhinovviridae
- 莫利可噬菌体科 Molycolviridae
- 友好噬菌体科 Naomviridae
- 奥拉-詹森噬菌体科 Orlajensenviridae
- 厚噬菌体科 Pachyviridae
- P2噬菌体科 Peduoviridae
- 漫游噬菌体科 Pervagoviridae
- 普切斯噬菌体科 Pootjesviridae
- 刺噬菌体科 Pungoviridae
- 朗特里噬菌体科 Rountreeviridae
- 萨弗曼噬菌体科 Saffermanviridae
- 萨拉玛噬菌体科 Salasmaviridae
- 猪尾噬菌体科 Saparoviridae
- 斯基托噬菌体科 Schitoviridae
- 希望噬菌体科 Speroviridae
- 斯坦·威廉噬菌体科 Stanwilliamsviridae
- 斯特拉波噬菌体科 Straboviridae
- 盐菌噬菌体科 Suolaviridae
- 富山噬菌体科 Toyamaviridae
- 梅园噬菌体科 Umezonoviridae
- 维尔丹尼噬菌体科 Verdandiviridae
- 翻转噬菌体科 Vertoviridae
- VLM群噬菌体科 Vilmaviridae
- 维诺噬菌体科 Winoviridae
- 科 Zierdtviridae
- 佐贝尔噬菌体科 Zobellviridae
- 有尾噬菌体纲 Caudoviricetes 1目
單鏈去氧核糖核酸病毒域 Monodnaviria
包含4界
- 洛布病毒界 Loebvirae 1门
- 桑格病毒界 Sangervirae 1门
- 称徳病毒界 Shotokuvirae 2门
- 科萨特病毒门 Cossaviricota 3纲
- 单环编码病毒门 Cressdnaviricota 2纲:编码复制相关蛋白的环状单链 DNA 病毒(Circular replication-associated protein-encoding single-stranded DNA viruses,CRESS DNA viruses)
- 精氨酸指针病毒纲 Arfiviricetes 5目
- 硅藻病毒目 Baphyvirales 1科
- 硅藻 DNA 病毒科 Bacilladnaviridae
- 圆环病毒目 Cirlivirales 3科
- CRESS亚基因组目 Cremevirales 1科
- 小环状 DNA 病毒科 Smacoviridae
- 连环病毒目 Gredzevirales
- 耶梦病毒目 Jormunvirales
- 德罗普尼病毒科 Draupnirviridae
- 多分体基因病毒目 Mulpavirales 3科
- 动物CRESS病毒科 Anicreviridae
- 中介病毒科Metaxyviridae
- 矮缩病毒科 Nanoviridae
- 圆形 CRESS 病毒目 Recrevirales 1科
- 圆形病毒科 Redondoviridae
- 戒环病毒目 Ringavirales
- 秘鲁圆环样病毒科 Pecoviridae
- 幽谷病毒目 Rivendellvirales
- 纳雅病毒科 Naryaviridae
- 洛汗病毒目 Rohanvirales
- 镇星病毒目 Saturnivirales
- 硅藻病毒目 Baphyvirales 1科
- Rep 单链编码病毒纲 Repensiviricetes 1目
- 双生基因植物真菌病毒目 Geplafuvirales 3科
- 精氨酸指针病毒纲 Arfiviricetes 5目
- 特拉帕尼病毒界 Trapavirae 1门
核糖病毒域 Riboviria
包含2界、2科、4属
- 正 RNA 病毒界 Orthornavirae 6门
- 双义病毒门 Ambiviricota
- 双链 RNA 病毒门 Duplornaviricota 3纲
- 金巨全病毒纲 Chrymotiviricetes 1目
- 加布里埃尔病毒目 Ghabrivirales 4科
- 亚目 Alphatotivirineae
- 科 Botybirnaviridae
- 金色病毒科 Chrysoviridae
- 科 Fusagraviridae
- 巨大双分RNA病毒科 Megabirnaviridae
- 科 Monocitiviridae
- 科 Orthototiviridae
- 科 Phlegiviridae
- 科 Pseudototiviridae
- 四组分病毒科 Quadriviridae
- 科 Spiciviridae
- 亚目 Betatotivirineae
- 科 Artiviridae
- 科 Giardiaviridae
- 科 Inseviridae
- 科 Lebotiviridae
- 科 Megatotiviridae
- 科 Ootiviridae
- 科 Pistolviridae
- 科 Yadonushiviridae
- 亚目 Gammatotivirineae
- 链格病毒科 Alternaviridae
- 亚目 Alphatotivirineae
- 加布里埃尔病毒目 Ghabrivirales 4科
- 呼肠孤病毒纲 Resentoviricetes 1目
- 维达弗病毒纲 Vidaverviricetes 1目
- 金巨全病毒纲 Chrymotiviricetes 1目
- 黄色病毒门 Kitrinoviricota 4纲
- 光滑裸露病毒门 Lenarviricota 4纲
- 二十病毒纲 Amabiliviricetes 1目
- 元素病毒目 Wolframvirales 1科
- 裸露 RNA 病毒科 Narnaviridae
- 元素病毒目 Wolframvirales 1科
- 豪厄尔镇病毒纲 Howeltoviricetes 1目
- 板栗疫病真菌病毒菌目 Cryppavirales 1科
- 线粒体病毒科 Mitoviridae
- 板栗疫病真菌病毒菌目 Cryppavirales 1科
- 光滑病毒纲 Leviviricetes 2目
- 密病毒纲 Miaviricetes 1目
- 二十病毒纲 Amabiliviricetes 1目
- 負核糖病毒門 Negarnaviricota 2亚门
- 简单病毒亚门 Haploviricotina 4纲
- 复杂病毒亚门 Polyploviricotina 2纲
- 布尼亚病毒纲 Bunyaviricetes
- 流感鲑贫血索戈托病毒纲 Insthoviricetes 1目
- 托州病毒科 Tosoviridae
- 小 RNA 病毒超群门 Pisuviricota 3纲
- 双链-小双节 RNA 病毒纲 Duplopiviricetes 1目
- 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes 3目
- 網巢病毒目 Nidovirales(嵌套病毒目)8亚目
- 深海病毒亚目 Abnidovirineae 1科
- 深海病毒科 Abyssoviridae 1亚科
- 动脉炎嵌套病毒亚目 Arnidovirineae 4科
- 冠狀病毒亚目 Cornidovirineae 1科
- 冠狀病毒科 Coronaviridae 2亚科
- 中型嵌套病毒亚目 Mesnidovirineae 2科
- 单嵌套病毒亚目 Monidovirineae 1科
- 单嵌套病毒科 Mononiviridae 1亚科
- 南海嵌套病毒亚目 Nanidovirineae 2科
- 桿狀網巢病毒亚目 Ronidovirineae 2科
- 曲凸嵌套病毒亚目 Tornidovirineae 1科
- [曲杆嵌套病毒科]] Tobaniviridae 4亚科
- 深海病毒亚目 Abnidovirineae 1科
- 微小核糖核酸病毒目 Picornavirales 8科
- 杯状病毒科 Caliciviridae
- 双顺反子病毒科 Dicistroviridae
- 傳染性軟腐病病毒科 Iflaviridae
- 海洋 RNA 病毒科 Marnaviridae
- 新颖病毒科 Noraviridae
- 小核糖核酸病毒科 Picornaviridae
- 多顺反子类小 RNA 病毒科 Polycipiviridae
- 伴生豇豆病毒科 Secoviridae 1亚科
- 红火蚁病毒科 Solinviviridae
- 南方菜豆花叶病病毒目 Sobelivirales 3科
- 囊孢虫RNA病毒科 Alvernaviridae
- 杯状 RNA 病毒科 Barnaviridae
- 南方菜豆花叶一品红病毒科 Solemoviridae
- 網巢病毒目 Nidovirales(嵌套病毒目)8亚目
- 星状-马铃薯病毒纲 Stelpaviricetes 2目
- 借宿病毒目 Yadokarivirales 1 family
- 借宿病毒科 Yadokariviridae 2 genera
- 裸露病毒科 Hadakaviridae
- 双 RNA 病毒科 Birnaviridae
- 复制酶置换四体病毒科 Permutotetraviridae
- 葡萄孢菌病毒属 Botybirnavirus 1种
- 副RNA病毒界 Pararnavirae 1门
- 多真菌病毒科 Polymycoviridae
- 小节肢动物病毒科 Sarthroviridae
- 烟草坏死卫星病毒属 Albetovirus 3种
- 绿萝卫星病毒属 Aumaivirus
- 黍花叶卫星病毒属 Papanivirus
- 烟草花叶卫星病毒属 Virtovirus
核酶病毒域 Ribozyviria
- 三角病毒科 Kolmioviridae
多变去氧核糖核酸病毒域 Varidnaviria
包含2界
- 班福病毒界 Bamfordvirae 2门
- 核质病毒门 Nucleocytoviricota 2纲
- 质粒前体病毒门 Preplasmiviricota 3纲
- 雅拉病毒科 Yaraviridae
- 海尔维蒂病毒界 Helvetiavirae(瑞士病毒)1门
地位未定种类
地位未定纲:
- 节肢动物核大DNA病毒纲 Naldaviricetes 1目、1科
地位未定科:
- 阿尔法卫星病毒科 Alphasatellitidae 3亚科
- 瓶状病毒科 Ampullaviridae 1属
- 指环病毒科 Anelloviridae 31属
- 鳄梨日斑类病毒科 Avsunviroidae 3属
- 巴通体GTA组病毒科 Bartogtaviriformidae
- 双尾病毒科 Bicaudaviridae 1属
- 短螺旋体GTA组病毒科 Brachygtaviriformidae
- 棒状病毒科 Clavaviridae 1属
- 微小纺锤形噬菌体科 Fuselloviridae 2属
- 球状病毒科 Globuloviridae 1属
- 滴狀病毒科 Guttaviridae 2属
- 嗜盐纺锤形噬菌体科 Halspiviridae 1属
- 伊察姆纳病毒科 Itzamnaviridae
- 卵形病毒科 Ovaliviridae 1属
- 芽生噬菌体科 Plasmaviridae 1属
- 多去氧核糖核酸病毒科 Polydnaviridae 2属
- 带球病毒科 Portogloboviridae 1属
- 马铃薯纺锤形块茎类病毒科 Pospiviroidae 5属
- 红细菌目GTA组病毒科 Rhodogtaviriformidae
- 螺旋病毒科 Spiraviridae 1属
- 奇古菌纺锤形噬菌体科 Thaspiviridae 1属
- 番茄曲叶卫星病毒科 Tolecusatellitidae 2属
地位未定属:
- 沟鞭藻 DNA 病毒属 Dinodnavirus 1种
- 壶菌病毒属 Rhizidiovirus 1种
亞病毒因子(Subviral Agents)
衛星(Satellites)
- 卫星病毒 Satellite virus
- 单链核糖核酸卫星病毒 Single-stranded RNA satellite virus
- 双链 DNA 卫星病毒 Double-stranded DNA satellite virus
- 未定属
- Satellite nucleic acid
- Single-stranded satellite DNA
- Double-stranded satellite RNA
- Single-stranded satellite RNA
- RNA satellite
- 未定属
類病毒(Viroids)
- Pospiviroidae
- Pospiviroid
- Hostuviroid
- Cocadviroid
- Apscaviroid
- Coleviroid
- 未定属
- Avsunviroidae
- Avsunviroid
- Pelamoviroid
- Elaviroid
- 未定科
朊毒體(Prions)
- Mammal-prion
- Fungi-prion
干扰缺损病毒(Defective Interfering)
- 缺损干扰 RNA Defective Interfering RNA
- Defective interfering particle
参考文献
- ^ Fields p. 27
- As defined therein, "a virus species is a polythetic class of viruses that constitute a replicating lineage and occupy a particular ecological niche". A“polythetic" class is one whose members have several properties in common, although they do not necessarily all share a single common defining one. Members of a virus species are defined collectively by a consensus group of properties. Virus species thus differ from the higher viral taxa, which are“universal”classes and as such are defined by properties that are necessary for membership.
- ^ Delwart, E.L. Viral metagenomics. Rev. Med. Virol.. 2007, 17 (2): 115–131. PMID 17295196. doi:10.1002/rmv.532.
- ^ ICTV Code. talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses. [2020-04-26]. (原始内容存档于2018-07-12).
- ^ Virus Taxonomy: 2020 Release. talk.ictvonline.org. International Committee on Taxonomy of Viruses. [2020-04-26]. (原始内容存档于2020-03-20).
- ^ Baltimore, D. The strategy of RNA viruses. Harvey Lect.. 1974,. 70 Series: 57–74. PMID 4377923.
- ^ van Regenmortel, M.H.; Mahy, B.W. Emerging issues in virus taxonomy. Emerging Infect. Dis.. 2004, 10 (1): 8–13. PMID 15078590.
- ^ Mayo, M.A. Developments in plant virus taxonomy since the publication of the 6th ICTV Report. International Committee on Taxonomy of Viruses. Arch. Virol.. 1999, 144 (8): 1659–1666. PMID 10486120. doi:10.1007/s007050050620.
- ^ de Villiers, E.M.; Fauquet, C.; Broker, T.R.; Bernard, H.U. & zur Hausen, H. Classification of papillomaviruses. Virology. 2004, 324 (1): 17–27. PMID 15183049. doi:10.1016/j.virol.2004.03.033.
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