普通細菌孔道蛋白家族
| 革蘭氏陰性菌孔道蛋白 | |||||||||||
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| 鑑定 | |||||||||||
| 標誌 | Porin_1 | ||||||||||
| Pfam | PF00267（旧版） | ||||||||||
| Pfam宗系 | CL0193（旧版） | ||||||||||
| InterPro | IPR001702 | ||||||||||
| PROSITE | PDOC00498 | ||||||||||
| SCOP | 1mpf / SUPFAM | ||||||||||
| TCDB | 1.B.1 | ||||||||||
| OPM家族 | 31 | ||||||||||
| OPM蛋白 | 1pho | ||||||||||
| CDD | cd01345 | ||||||||||
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普通細菌孔道蛋白是一類存在於革蘭氏陰性菌外膜上的蛋白質。這類蛋白充當了對親水性物質的分子過濾器[1]，在外膜上起着「分子篩」的作用。這些蛋白生成的裝滿水的通道可讓親水性物質進入週質空間中。部分孔道蛋白生成的擴散通路可允許大小小於排阻極限的溶質通過，而另一些則在孔道內有特異性的結合位點，只能允許一種溶質通過。孔道蛋白是細菌外膜上的一種主要蛋白質，噬菌體和細菌素常常會通過它們與細菌結合。
細菌孔道蛋白常常會結合成三聚體。而它們的β鏈則是這些蛋白質的跨膜核心[2]。有證據表明[3]一些孔道蛋白與淨化有關。這些蛋白質有：
- Enterobacteria PhoE, OmpC, OmpF, NmpC.
- Bacteriophage PA-2 LC.
- Neisseria PI.A, PI.B
亞家族
參考
- ^ Benz R, Bauer K. Permeation of hydrophilic molecules through the outer membrane of gram-negative bacteria. Review on bacterial porins. Eur. J. Biochem. 1988, 176 (1): 1–19. PMID 2901351. doi:10.1111/j.1432-1033.1988.tb14245.x.
- ^ Jap BK, Walian PJ. Biophysics of the structure and function of porins. Q. Rev. Biophys. 1990, 23 (4): 367–403. PMID 2178269. doi:10.1017/S003358350000559X.
- ^ Pattus F, Jeanteur D, Lakey JH. The bacterial porin superfamily: sequence alignment and structure prediction. Mol. Microbiol. 1991, 5 (9): 2153–2164. PMID 1662760. doi:10.1111/j.1365-2958.1991.tb02145.x.